Khi mua sữa chua, phải xem hạn dùng còn dài mới mua (ngắn cũng phải còn 20 ngày). Về nhà, phải cho ngay sữa chua vào tủ lạnh (khoang lạnh có nhiệt độ từ 5 - 6oC) để bảo quản.

Không ăn sữa chua lúc bụng đói, đó là lúc độ chua của dịch dạ dày cao nhất, sẽ tiêu diệt phần lớn các vi khuẩn có ích trong sữa chua. Để tránh tác hại này, trước khi ăn sữa chua, ta nên làm giảm độ chua của dịch dạ dày (có nhiều cách như: ăn 1 quả chuối chín hoặc vài miếng đu đủ chín hoặc 1 quả dưa chuột hoặc vài cái bánh quy mặn... rồi uống 1 cốc nước nhỏ 50ml), sau đó mới ăn sữa chua. Tốt nhất nên ăn sữa chua sau bữa ăn khoảng 1 giờ.

Người bị viêm họng nên lấy sữa chua ra khỏi tủ lạnh 10 phút, sau đó pha thêm 1 ít nước nóng vào sữa chua cho "tan giá"  rồi mới ăn (tuyệt đối không được đun nóng sữa chua sẽ chết các vi khuẩn có ích trong sữa chua).

Ăn sữa chua phải cách xa lúc uống thuốc kháng sinh tối thiểu là 3 giờ để tránh các vi khuẩn có ích trong sữa chua bị tiêu diệt.

Người tiểu đường, người dư cân chỉ ăn sữa chua không đường.

Sau khi ăn sữa chua cần súc miệng và đánh răng thật sạch để tránh các vi khuẩn lactic trong sữa chua còn sót lại làm hỏng men răng.